Наиболее распространенными причинами заболеваний щитовидной железы являются аутоиммунные заболевания, в частности тиреоидит Хашимото и болезнь Грейвса / диффузный токсический зоб. При аутоиммунном заболевании иммунная защита организма ошибочно, в некотором роде, идентифицирует щитовидную железу как чужеродную организму.

Заболевание Хашимото может вызывать периоды гипертиреоза, с последующим постоянным гипотиреозом, поскольку антитела, созданные иммунной системой, разрушают ткани железы и способность вырабатывать тиреоидные гормоны.

При болезни Грейвса антитела заставляют щитовидную железу вырабатывать чрезмерное количество тиреоидных гормонов, состояние, которое называют гипертиреозом / тиреотоксикозом и которое может стать опасным для жизни, если не лечить.

Если у вас диагностируют болезнь Грейвса / диффузный токсический зоб, то вы вероятно получите антитиреоидные препараты, или радиоактивный йод, или пройдете хирургию, что частично или полностью повредит способность щитовидной железы вырабатывать тиреоидные гормоны. Большинство людей получают состояние гипотиреоза после лечения болезни Грейвса.

Риск развития заболевания щитовидной железы является наибольшим если:

• У вас или у члена семьи есть история проблем со щитовидной железой
• У вас или у члена семьи есть история аутоиммунного заболевания (например, ревматоидный артрит, псориаз, витилиго, рассеянный склероз, волчанка, или другие заболевания)
• Вы являетесь или были курильщиком
• У вас была в прошлом желудочно-кишечная инфекция, особенно, если инфекция диагностировалась как вызванная пищевой бактерией иерсиния энтероколитика (лат. Yersinia enterocolitica).
• У вас есть аллергии или чувствительность к глютену (растительному белку), или были диагностированы целиакией
• Вы подверглись воздействию радиации, живя вблизи или по направлению ветра от АЭС, или через конкретное медицинское лечение (например, лечение болезни Ходжкина, облучение миндалин и области шеи), имели многочисленный рентген зубов или шеи (без тиреоидного воротника), или были близко или по направлению ветра от Чернобыльской катастрофы в 1986 году
• Вы лечились препаратами лития или амиодароном
• Вы принимали добавку йода, ламинарии или фукус пузырчатый
• Вы живете в районе, где низкое содержание йода в почве, или вы значительно сократили потребление йодированной соли
• Вы подверглись воздействию чрезмерного количества экологических эстрогенов, токсинов, и других химических веществ (например, перхлорат, фторид, бисфенол А) через воду, пищу, или трудовую деятельность
• Вы подверглись чрезмерному воздействию металлов, в числе которых ртуть
• Вы пьете фторированную воду и используете фториды (фторированная зубная паста, лечение фторидом)
• Вы потребляете значительное количество продуктов сои, особенно соевые порошки или добавки на основе сои.
• Вы потребляете существенное количество гойтрогенных продуктов, таких как брюссельская капуста, брюква, репа, кольраби, редис, цветная капуста, просо, белокочанная капуста
• Вам больше шестидесяти
• Вы женщина
• Вы находитесь в периоде гормональных изменений, таких как, перименопауза, менопауза, беременность, или послеродовом
• У вас была серьезная травма шеи
• Вы в настоящее время или в прошлом диагностированы любым из следующих заболеваний или состояний, встречающихся, как известно, чаще у людей с заболеванием щитовидной железы:

• Разные гипофиза или эндокринные заболевания (например, диабет, опухоль гипофиза, синдром поликистозных яичников, эндометриоз, преждевременная менопауза, заболевания надпочечников)
• Синдром хронической усталости
• Фибромиалгия
• Синдром запястного канала, тендинит, подошвенный фасциит
• Пролапс митрального клапана
• Вирус Эпштейна-Барр
• Мононуклеоз
• Депрессия
• Бесплодие или невынашивание беременности
• Целиакия (непереносимость глютена)